起初，人类感染缘于与具有北非果蝠群落栖息的矿山或者洞穴长期接触。

　　 疾病传播主要在人与人之间进行，由于密切接触到感染者的血液、分泌物、器官和其它体液造成。在葬礼上，哀悼者与死者尸体直接接触，这对马尔堡的传播可有重要作用。通过受到感染的精液传播情况可在临床康复之后的七周时发生。

　　 治疗马尔堡病人时，由于没有采用正确的感染控制防护措施而发生密切接触，就出现过传染给卫生保健工作者的情况报道。通过受污染的注射器械或者通过针头扎伤传播，与疾病更为严重、迅速出现恶化以及可能出现较高病死率存有关联。